次のようなエージェントで対応できそうですが、サーバー(Domino)側で自動実行させる場合、サーバーにExcelのインストールが必要です。
なお、実行時に権限のエラーが発生する場合、エージェントの「実行時のセキュリティレベル」で"制限された操作を許可する"に変わっているかと、実行するDominoサーバーのサーバー文書のセキュリティタブにある「可能なプログラムの制限」あたり、それからファイルの書き出し先となる場所(下の例では C:\temp フォルダ)の権限まわりをチェックしてみてください。
Dim ss As New NotesSession
Dim vw As NotesView
Dim ec As NotesViewEntryCollection
Dim ent As NotesViewEntry
Dim doc As NotesDocument
Dim filepath$, row&
Dim app, book, sheet
filepath = "C:\temp\sample.xlsx"
Set app = CreateObject("Excel.Application")
app.DisplayAlerts = False
app.visible = False
app.Workbooks.Add
Set book = app.Workbooks(1)
Set sheet = book.Worksheets(1)
Set vw = ss.Currentdatabase.Getview("testview")
Set ec = vw.Allentries
Set ent = ec.Getfirstentry()
While Not ent Is Nothing
row = row + 1
Set doc = ent.Document
sheet.Cells(row,1).value = doc.Universalid
Set ent = ec.Getnextentry(ent)
Wend
book.SaveAs(filepath)
book.Close
app.Quit
Set sheet = Nothing
Set book = Nothing
Set app = Nothing